Le jour de ses 15 ans, Eli Shane découvre enfin le monde souterrain de Slugterra dont son père lui a tant parlé avant de disparaître. Mais, il a tout à apprendre et ce nouvel univers est plein de dangers. Avec l'aide de sa fidèle slug Burpy, le jeune garçon va devoir s'adapter très vite à son nouvel environnement.